馬里全國有大小機場近30個，其中巴馬科、加奧、莫普提、錫加索和通布圖機場為國際機場。塞努國際機場位于巴馬科市郊，為主要國際機場，可供大型客機起降，每晚有一法航班機飛往巴黎，巴馬科機場與市區間有快速公路，可乘出租車或自駕車往返。此外，西班牙、摩洛哥、科特迪瓦、阿爾及利亞、埃塞俄比亞、塞內加爾、肯尼亞、幾內亞等國航空公司均有航班經停巴馬科機場。馬里與中國無直航，中馬之間國際航空旅行須經巴黎、亞的斯亞貝巴、內羅畢等地轉機。

 

公路運輸占馬里交通運輸量的90%。巴馬科與鄰國主要城市阿比讓、洛美、科納克里間有公路干線連通。須具有當地駕照方可駕車。馬里車輛靠右行駛，主路車輛優先，交通規則與中國基本一致。由于整體路況較差，車輛超載嚴重，摩托車數量眾多且車速快，交通事故頻發。公路運輸費用昂貴，可占到商品成本的35%。

 

巴馬科市內交通主要依靠一種名為“索特拉馬”（SOTRAMA）的私營面包車，票價很低（100西郎起），車齡多在10年以上，安全性差。巴馬科出租車眾多，但車況差，大部分為歐洲老舊奔馳車，事故頻發。2010年以來，馬里出租車司機合作社在銀行貸款支持下購買了一批中國自主品牌車型，成為巴馬科出租車市場新生力量。巴馬科出租車不按公里收費，一般按地點收取1,000到1,500西郎不等。

 

應特別注意的是，巴馬科摩托車數量多且車速過快，頻發交通事故。巴馬科市內交通擁堵較嚴重，出行需安排好時間。

 

馬里全國鐵路總長728公里，巴馬科-達喀爾鐵路馬里段為重要貨運運輸通道。鐵路運輸以貨運為主，列車平均時速60公里。

 

尼日爾河和塞內加爾河為馬里的內河通航航道，但水路運輸不發達，干旱、沙漠化、河道泥沙淤積等造成通航時間不斷減少，加上馬里航運公司的船只年久失修，內河運輸量很小。

 

負責內河航運經營和管理的馬里航運公司，其總部設在庫利科羅，目前該公司有郵船、平底駁船等各類船只數十艘。馬里私營渡河獨木舟安全性差，時有翻船溺水事件發生，建議不要輕易乘坐。

 

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